Je höher die Produktvielfalt, je kleiner die Charge, desto eher kommt eine diskontinuierliche Fertigung in Betracht. Bei dieser Fertigungsvariante sind die einzelnen Prozessinseln (z.B. für das Gären oder Backen) durch spezialisierte Transport- und Beschickungstechnik miteinander verknüpft und als Inseln meist auch automatisiert. Innerhalb des Gesamtsystems behalten sie aber einen hohen Grad an Autonomie und lassen individualisierte Prozesse recht einfach zu. Ein Backofen mit mehreren Etagen kann beispielsweise nach wie vor in Herdgruppen oder einzelnen Herden angesteuert werden und ganz unterschiedliche Produkte backen, durchaus sogar gleichzeitig.

Auf diesem Weg, noch nah verwandt mit der klassischen Denkweise der Handwerksbäcker, lassen sich breite Sortimente von der Konditoreiware bis hin zum Brot in durchaus beeindruckenden Stückzahlen effizient und weitgehend automatisiert herstellen. Die Planung des geschmeidigen Produktionsflusses bleibt aber meist Aufgabe des Bäckers oder Betriebsleiters.